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发信人: RUOYE (心在网络中失落), 信区: CST
标 题: Internet网上的免费分子生物学软件
发信站: BBS 荔园晨风站 (Sun Sep 17 12:52:55 2000), 转信
Internet是一个大宝藏，对研究分子生物学的人来说尤其如此，因为
Internet上有大量的免费分子生物学软件与各种蛋白质、核酸和酶数据库，应用它
们，可以极大推动我们的研究工作。
Internet网上的免费工具软件有在线与离线两种形式。对于在线工具软件，只
要通过浏览器，输入一定的信息，便可得到相应的结果，例如二级序列分析、PCR
引物设计等信息。而离线工具软件，只要下载了这个软件，便可在本地电脑上使用
。当你在互联网上找到了一个免费工具软件时，第一个应注意的便是此工具软件的
操作平台。在国外，大约50%的分子生物学家使用苹果机（Macintosh），10%使用
Unix系统，因此，基于这两个平台的免费软件在网上有许多。而我国绝大多数分子
生物学家使用PC机与Windows操作系统。本文介绍的均为基于Windows的离线分子生
物学免费工具软件。
免费软件往往是由个人或一个小集体开发的，其目的大多是为自己的工作方便。作
者们不计较个人利益，将自己精心开发的软件放在Internet上，供全世界同行下载
使用。与商业软件不同，大多数免费软件的帮助文件都非常简单，而且作者，没有
时间与义务回答用户的询问，只有靠用户自己慢慢摸索使用。另外，软件并未经过
严格测试，常常含有一些小的错误与漏洞，软件界的术语叫作“bug”，作者不对
这些bug造成的危害负责，用户则有义务将发现的bug通知原作者，以使在下一个版
本中改正。
1. 生物分子三维结构观察与演示软件
1.1 RasMol RasMol是一个非常有名的软件，用来显示蛋白质、核酸以及小分子
的三维立体结构。它可以用各种不同的显示模式与颜色显示生物大分子，还可以在
三维下旋转、展示生物分子，对教学、展示与论文教材撰写，有很大帮助。最新的
版本为2.7。其下载站点为：http://www.umass.edu/microbio/rasmol/。目前，该
Windows版本包括帮助文件已经被Hoyoyo汉化，这也可能是第一个被汉化的分子生
物学工具软件，操作界面与帮助文件均为中文，用户使用将非常亲切。汉化后的
RasMol 2.7下载站点为：hoyoyo生化软件下载专区(http://www.nease.
net/~hoyoyo/www/bcmsoft.htm)。在我的站点提供了下载链接：免费生物化学软件
天地（http://biosoft.yeah.net），并附简单中文使用说明。
1.2 CHIME CHIME 是IE与NetScape浏览器插件。安装该软件后,可以直接用浏览
器观看PDB格式的生物分子文件，直接在浏览器中观看3D分子，进行显示模式与颜
色模式更改，旋转等操作。不需RASMOL,对网上浏览非常方便。最新版本为2.0。下
载站点与RasMol相同。
1.3 MolMol MolMol是另一个显示蛋白质、核酸三维结构的软件，通过其微调功
能，调节3维效果，如阴影、打光、反射等，可以生成非常漂亮的三维图形，应用
于论文与教材让人赏心悦目。有完整的说明和教学文件，教你如何使用。站点为：
http://www.mol.biol.ethz.ch/wuthrich/software/molmol/ ，最新版本号为2.
5.1。
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※ 来源:·BBS 荔园晨风站 bbs.szu.edu.cn·[FROM: 192.168.39.224]
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