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发信人: RUOYE (心在网络中失落), 信区: CST
标  题: Internet网上的免费分子生物学软件
发信站: BBS 荔园晨风站 (Sun Sep 17 12:57:41 2000), 转信

4. DNA分析

4.1 DNATool DNATool是一个功能很全面的DNA序列分析工具,它不是免费软件而是
共享软件,允许你免费使用3个月,3个月后便拒绝运行,除非你交钱注册。其功能
有:序列编辑与类似序列查找、建立自己的序列数据库进行查找、多序列比较、序
列翻译、蛋白质序列分析、引物设计与分析、基因表达序列分析(SAGE)功能等,
还包括DNA分析常用的功能,如碱基百分组成、分子量计算等。超期后,将计算机
时钟调回3个月内,仍能继续使用。最新版本为5..1.570,下载网址:http:
//www.crc.dk/phys/A01B04_dnatools.htm。
4.2 DNA Club     一个中国留美学生所编写的DNA分析软件,功能包括:序列编辑
、查找、PCR引物设计、引物评估、限制酶分析等功能,操作界面友好方便,最新
版本:1.5,下载站点为:http://128.84.203.244。

4.3 ANNHYB     用来设计PCR引物与设计基因探针,对短DNA序列,它可生成互补
序列、预测融点温度、计算GC百分含量、计算分子量、计算摩尔消光系数等。是一
个有用而方便的小工具。目前版本:2.21,下载站点:http://pcgen018.
molinette.unito.it/programs/ 。
4.4 RESTRICTION ANALYSIS RESTRICTION    ANALYSIS用来获得限制酶消化结果。
用户定义需消化的序列以及在限制酶数据库中指定所用的限制酶,程序便输出消化
的结果。目前的版本为Beta版,下载地址:http://pcgen018.molinette.unito.
it/programs/。
4.5 JaMBW    Java语言是一个跨操作平台的语言,只要这个系统有支持Java语言
的环境即可。在Windows环境下,IE与Netscape 浏览器均支持Java 语言,所以用
Java语言编写的分子生物学软件包JaMBW便是在浏览器下工作的。JaMBW包含了分子
生物学研究常用的一些操作:序列格式转换、求序列的互补序列与逆序列、将DNA
序列翻译成蛋白质序列、序列分析、多序列比较、特征位点查找、3维分子结构查
看、PCR引物设计、缓冲液设计等功能,最新版本号为1.1,下载站点:http:
//www.embl-heidelberg.de/JaMBW/main.html。
4.6 pDRAW    pDRAW也是一个DNA分析工具。它包括DNA序列输入与分析、限制酶消
化分析以及环形与线性DNA图形输出等许多功能。作者已经将许多选择设计成选项
,只须你选择即可,非常方便。最新版本号:1.0.33,下载网址:http://www2.
crosswinds.net/~acaclone/。

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※ 来源:·BBS 荔园晨风站 bbs.szu.edu.cn·[FROM: 192.168.39.224]


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