不过斯坦因却提出了不同的看法，认为四个木雕应该不是所谓的舞女，而是四尊严重脱去本相的木质菩萨雕塑。因为从木质上来看，虽然其表面平滑，但是仍布满了大大小小的蜂孔，这显然是风蚀的另一杰作。斯坦因同时也表示，菩萨雕像失去了本来面目，虽然有风蚀的原因，但同样也可能是太注重写意风格，导致其本身面貌无从考证。
佛塔能够在世间存有遗迹，说明了古代工匠的匠心独具，同时也表明其迫切需要进行修缮。在此之前，曾有专家提出对其进行勘探发掘，但却被相关建筑学家拒绝，称该佛塔内部结构已经十分脆弱，随时都有倒塌的危险，贸然进行发掘，不仅是对文化遗产的不负责任，更增加了作业的危险性。基于此种原因，建筑专家们便对佛塔进行了修补，不仅在其外部设计稳固栏，其内部中空结构也被填塞大量的黏土及红柳枝，专门用于固定流沙，延缓风蚀与沙蚀的危害。最后，建筑专家还采取编号的形式，对佛塔土坯展开二次砌筑，既保持了佛塔的原貌，又令其稳定性得到提高。
据建筑专家称，从目前的建筑工艺来看，佛塔虽然经过了一系列的修补，但我们能够做到的，只是延缓其消失速度，却不能阻止它彻底崩塌。不过在这里我们希望，随着科学技术的不断提升，这座尼雅中心佛塔，希望更长久地保存下去，再次见证华夏的伟大与繁荣。
