虽然周王所谓的谋反并无任何实证，朱橚还是被废为庶人，并发配至云南蒙化监禁。至于朱有爋，史书还在记录他是否一起被废。但从周王在平反之后对其切齿痛恨来看，这位汝南王应该是保住了他的荣华富贵。发配云南
建文四年六月，燕王朱棣率领的靖难大军攻入南京，朱允炆在奉天殿自焚。朱棣登基之后立刻给弟弟平反，此时该如何处理逆子朱有爋，成为了一个难题。
周王的要求非常的简单粗暴，就是这个逆子不要了，希望朝廷能够将其诛杀。但对于朱棣来说建文帝刚死，朝局尚未稳定，此时若赐死朱有爋，容易给人安上"残害宗室"的帽子，这并不是朱棣所希望的。
因此朱棣在考虑再三之后，提出将朱有爋发配至云南居住。一来让朱有爋远离其父，以免让弟弟背上杀子的恶名。其二让其居于云南，也是对其当年出卖生父的惩罚。其三云南沐家素来站队建文帝，朱棣虽让弟弟岷王朱楩复国云南，尤嫌不足。而朱有爋到了云南之后居住于大理，和镇守昆明的岷王一东一西，可以紧紧掐住云南最重要的两座城池。建文中有爋尝告其父定王不轨，父被削夺囚系。至太宗皇帝临御，其父始释复爵，遂奏乞诛有爋。太宗委曲解之，遣有爋居云南大理，以释其父憾。—《明宣宗实录卷二十七》
大理古城
因此朱有爋说是发配，其实待遇一点不差。他临行之时，朱棣特赐钞二万锭，又岁给他禄米两千石。永乐元年四月又下旨在大理修建汝南王府，看样子这是打算让朱有爋在云南长期抗战了。在汝南王抵达云南之后，朱棣还特地写信对他进行勉励。赐汝南王有爋书曰：汝在远，吾念之不忘，今特赐币帛等物。其修身慎行，致力诗书，以副朕怀。—《明太宗实录卷二十五》
永乐二年十一月初，朱有爋来朝贡马，朱棣让皇太子朱高炽在文华后殿设宴招待。等到十一月中旬周世子朱有燉来朝的时候，朱棣还特地安排俩兄弟见面以联络感情。说实话，朱棣这个四伯为了这个侄子可以说是操碎了心。
朱有爋在云南一待多年，朱橚始终没有原谅这个儿子。直到永乐二十年，朱有爋的生母冯氏去世，朱棣才借着这个机会把朱有爋一家从大理调回了开封。敕周王橚曰：汝南王母殁，子妇咸应守丧。其及宫人在大理者，即令人取回。—《明太宗实录卷二百五十四下》
虽说朱有爋回到了开封，但朱橚压根就不想让他们住进王府。洪熙元年三月，周王向新皇帝仁宗朱高炽建议以河南都司衙门，作为汝南王及其家属的住所。仁宗表示都司衙门不可移易，汝南王家属可在三护卫衙门内选个宽敞地方给他们居住。闰七月，周王朱橚去世，这段纠葛20多年的父子恩仇终于告一段落。机关算尽太聪明，反误了卿卿性命
虽然朱棣费尽心思化解朱有爋和其父朱橚之间的过节，又精心创造机会为汝南王和周世子之间提供见面机会。但流放云南的二十多年，显然让本就一肚子坏水的朱有爋心理更加扭曲，对其父和其兄充满了怨恨。
因此在回到开封之后，眼瞅着新继位的宣宗朱瞻基削藩之心盛于乃祖，不安分的朱有爋再次动起了坏脑筋。宣德元年八月，宣宗御驾亲征平定汉王之乱，朱有爋却趁机构陷其兄嗣封周王朱有燉。
可惜宣宗确实是要削藩，但周王府的河南三护卫早在五年前便已上交给了朝廷，朱瞻基又何必去找朱有燉这只没牙老虎的麻烦呢？他特地遣书安慰周王称："过虽在彼，叔宜笃爱弟之心，不足与校。"
其实朱橚是为医药学家，朱有燉则是戏剧文学家，二人的权力欲望本就不高，何况朱有燉成婚多年一直无嗣。朱橚曾经让朱有爋把庶长子朱子墐过继给朱有燉，这样朱有燉去世以后，朱子瑾就能袭封周王。有燉无子，有爋庶长子子墐生数月，定王命为有燉后，有燉甚爱之。—《明宣宗实录卷二十七》
宣宗朱瞻基剧照
可惜朱有爋小算盘打得实在太精，他看大哥多病，起了"兄终弟及"的念头。于是他不顾兄长的好言相劝，硬是把朱子墐从周王府中要了出来，重新和自己生活在一起。这样朱有燉一旦去世，他汝南王就能名正言顺地继任周王。定王薨，世子嗣封，时多病。有爋意嗣王有不幸而无子，即己当嗣，遂百计欲夺子墐归。不得则形之忿詈，嗣王不获己，竟遣子墐归有爋所。—《明宣宗实录卷二十七》
