接到书信后，明世宗紧急召见大臣商议如何处置，严嵩竟然说出了“所此抢食贼耳，不足患”这样的惊人之语，徐阶等人虽然对严世蕃的言论予以了驳斥，但也认为无条件答应俺答汗的条件太过没面子，于是便又派杨增跑去与俺答汗商议，让其先行撤军，之后再在大同就贡市问题进行商谈。
八月二十二日，俺答由巩华城攻诸帝陵寝，转掠西山、良乡以西，之后才于次日开始撤军。据统计，整个庚戌之变期间，“诸州县报所残掠人畜二百万”，而明廷之后也是答应了对方的贡市需求，俺答汗堪称“满载而归”。
如上所述，虽说“土木堡之变”明军同样战败、且就连皇帝也被俘虏了，但那毕竟是明朝主动出兵抵御外敌而遭遇的战败，且在之后的“北京保卫战”中找回了场子，而瓦剌可汗脱脱不花和太师也先不久也因内部动荡而先后主动与明朝议和，说起来倒也不算多么丢人。而在“庚戌之变”之中，明廷却是连打都不敢打，任凭蒙古军队在眼皮子底下纵兵劫掠。因此，我认为“庚戌之变”明朝遭受的耻辱，要远甚于“土木堡之变”。
