清朝是少数民族建立的王朝，它之所以能够统治中国长达200余年，其中原因虽然很多，但妥善地处理与蒙古的关系，进而获得蒙古封建主的强力支持，是极其重要的原因之一，因此有人认为清朝是以“满蒙联合统治为主的政权”。从其统治利益出发，清朝以蒙古为其政权的重要支柱，一方面希望它强大有力，另一方面又要确保它对自己效忠。
清朝统治者花费长达一个多世纪的时间，逐渐确立了对蒙古族的政策，并日益制度化。其中，核心政策是对蒙古采取一系列优待措施，使其成为可以信赖的力量。
第一，确立蒙古封建主的特殊地位。清朝将蒙古视为盟友，使其地位仅次于满洲，高于国内其他民族。清朝承认蒙古贵族拥有一定的自治权，在大部分蒙古地区实行盟旗制度，通过蒙古上层间接统治蒙古平民，蒙古地区不必担负国家赋税，经济上受到许多优待。
清朝仿照满洲爵制，规定了蒙古封建主的爵位制度，分为亲王、郡王、贝勒、贝子、镇国公、辅国公、台吉或塔布囊，并在其上保留原来的汗。蒙古贵族授封王公者甚至多于满洲，而且一般都原格承袭，有别于满洲降级继承。顺治皇帝晓谕蒙古诸部：“我国家世世为天子，尔等亦世世为王，享富贵于无穷，垂芳名于不朽”（《清世祖实录》卷103，顺治十三年八月丙子朔）。据笔者统计，光绪末年全蒙古有汗5人，王42人，贝勒28人，贝子29人，公70人，扎萨克台吉或塔布囊71人，共计245人。
这些人参加“朝会燕飨”，班次紧随满洲同一爵级者之后，地位尊崇，礼遇优厚。清朝政府还实行年班、围班制度，使蒙古贵族每年轮流到北京和承德觐见皇帝，皇帝则给予丰厚的赏赐，并举行各种娱乐活动，使彼此感情更趋融洽。
第二，建立“甥舅之亲”“世缔国姻”。满蒙联姻是一种大规模、多层次、持续的政治行为。清太祖努尔哈赤娶蒙古贵族之女为妻。清太宗皇太极同样娶蒙古贵族之女，并生福临即顺治皇帝。其他很多皇室子弟及贝勒大臣等也娶蒙古贵族之女。
另外，很多清朝皇帝及宗室成员招蒙古贵族为女婿。满洲皇室的女婿被称作“额驸”，虽然不是皇族，但是皇族外戚，封有爵位，握有大权。1612—1912年，嫁给蒙古贵族的公主、格格共432人（杜家骥《清朝满蒙联姻研究》，人民出版社2003年版），而他们的子孙散居各部者为数更多。据史书记载，光绪末年，科尔沁达尔汉王旗的公主子孙台吉、姻亲台吉有2000人，土谢图王旗522人，敖汉旗610余人，巴林旗170余人（《钦定大清会典事例·理藩院》，中国藏学出版社2006年版）。
这还只是部分蒙旗情况，其他大部分地区尚不在内。因此，许多蒙古贵族都与满洲贵族有亲属关系，乾隆皇帝在招待蒙古王公的一次宴会时坦言：“其令入宴者，率皆儿孙行辈”（昭梿《啸亭杂录》，中华书局1980年版）。这说明，蒙古贵族与满洲皇室关系之密切，是国内其他民族所无法比拟的。
第三，实行封禁保护政策。清朝适度限制内地汉民迁入蒙古地区垦殖，以保护蒙古人以畜牧业为主的经济生活。清朝还限制蒙古人与汉族之间的交往，目的是防止蒙古人由于摄取汉文化、蒙汉通婚而引起同化。当时，蒙古族的经济文化落后于汉族，难以承受来自人口众多、经济文化较为发达的汉族人口的冲击。
这种冲击容易造成蒙古族固有的经济文化走向衰退，进而引起蒙古社会的动荡，触及清王朝的边疆安全。清朝考虑自身统治利益而采取的封禁政策，在一定范围内对蒙古民族共同体起到保护作用，客观上也保护了蒙古地区的生态环境。应该指出的是，清朝一方面实行封禁政策，限制蒙汉民族交往；另一方面，通过中原与蒙古地区的互市贸易，以及内地商人去蒙古地区经商等形式，互通有无，以此弥补单一游牧经济之不足，使蒙古社会得到中原经济的支援。