雍正命刑部严审菩萨保。但他牵连隆科多，家族亦多有显贵，其堂兄弟傅尔丹为领侍卫内大臣兼黑龙江将军。满人盘根错节的人情关系，相互保护。刑部满尚书塞尔图将菩萨保与隆科多的罪责轻描淡写，还将首告依“家奴告主”拟以重罪。
雍正要将与允禩、隆科多关联的人连根拔起，自然不会对塞尔图的敷衍塞责满意。他怒不可遏地另派王公大臣审讯刑部所有堂官，欲治其党恶徇私、肆行欺罔之罪。
第二天，雍正的圣旨来了：“天气暑热，刑部事件要紧。菩萨保一案，励廷仪亦难说无过。但伊系汉人，着回部办事。黄国材、鄂尔奇俱着办理刑部事务，务须秉公同办，不必分别满汉。”（《雍正起居注》第二册）
雍正帝将塞尔图发遣黑龙江，命正黄旗汉军都统黄国材、户部尚书兼步军统领鄂尔奇（满洲镶黄旗人）办理刑部事务；将刑部右侍郎高其佩（汉军镶白旗）革职，转在都统行走；以励廷仪错拟菩萨保罪名，给了一个奉旨革职留任的处分。
满人部权特重，励廷仪无实际话语权。雍正自然知道，特地指示以后“不必分别满汉”，寄望励廷仪不畏权贵，彻底贯彻他抑制满洲亲贵的政治意图
最后挖出隆科多四十一款罪状：大不敬之罪五、欺罔之罪四、紊乱朝政之罪三、党奸之罪六、不法之罪七、贪婪之罪十六。世宗在雍正八年升刑部右侍郎海寿为刑部尚书时，特命汉尚书励廷仪行走在前。海寿为满洲正白旗，理应反超居其上。
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昭梿《啸亭续录》卷一写康熙的南书房，说：“仁庙与诸文士赏花钓鱼，剖析经义，无异同堂师友。故一时卿相如张文和、蒋文肃、厉尚书廷仪、魏尚书廷珍等皆出其间，当代荣之。列圣遵依祖制，宠眷不衰，为木天储材之要地也。”
“厉尚书”即励廷仪，为康熙三十九年进士，丁母忧还未守制满期，即被特命在南书房行走。他做过日讲起居注官，擢内阁学士，充经筵讲官。康熙晏驾当月，他刚任翰林院掌院学士。雍正继位，旋即以其为兵部右侍郎，兼掌翰林院。
雍正帝是要重用他。十年后，励廷仪病逝，雍正揭开此中原委，一是励廷仪是康熙帝教育出来的人才，二是励父励杜讷“老成端谨，学问优长。朕幼年在宫中读书时，资自讲论，至今念之不忘”（《清史列传·励廷仪传》）。
励廷仪和张廷玉一样，他们的父亲都曾入直内廷，都曾给康熙、雍正二帝上过课。励廷仪先于张廷玉两年入值南书房，也跟老康熙讲过经义。
他们同雍正帝，有师兄弟之谊，且该在康熙朝多有交流。雍正对恩师们的儿子，是信任的，是倚重的，即位时，径直任命张廷玉、励廷仪和翰林院掌院学士阿克敦办理大事典礼翰墨，供几筵祭告文字。随后，将他们提拔至要害部门当尚书。
张廷玉任礼部尚书，励廷仪做刑部尚书。他们跻身于枢臣之列。
雍正为排除异己运筹帷幄，以刑部事繁杂、礼部事简单，命张廷玉接替励廷仪兼任掌院学士。他在期待励廷仪专心料理刑部事务，成为他议罪政敌的代言人。
哪知他的问题不断，屡遭弹劾。雍正只好一再降旨宽免。即便因监管不力，手下侍郎高其佩擅改皇帝的新宠田文镜拟定的斩决为监候，被革职也是很快复职。
励廷仪职掌刑部十年，于雍正九年迁任吏部尚书，仍管刑部尚书事；在雍正十年五月以病乞休，也被皇帝慰留。这，证明雍正帝始终对他有着特别的安排。
他除了对整治科举考场、私盐市场和清查官员收入等问题，提出了一些建设性意见外，对雍正特殊的政治需要并无多大的贡献。他曾主审谢济世案，谢氏一番孔孟教导的忠臣论，当堂驳斥得励廷仪出尽了洋相。
而张廷玉政绩突出，深得雍正的欢心，被委以多任，视作“大臣中第一宣力者”：“朕即位十一年来，朝廷之上近亲大臣中，只和你一天也没有分离过。我和你义固君臣，情同密友。如今相隔月余，未免每每思念。”话语肉麻，也是真性情也。
