当这一系列改革与核所高度以吴宜灿所长为核心的管理模式相遇时，双方激烈冲突的伏笔早已埋下，于是形成了6月15日当天的对峙及集体辞职。
有匿名网友6月12日在某论坛上对合肥院改革举措予以批驳时称，“据说岛上某新科院士正在谋划携团队百余号成员集体‘出走’物质院。”
澎湃新闻了解到，吴宜灿本人目前并未离职。
据核所官网消息，6月17日下午，也即在安保冲突和集体辞职事件发生的两天后，吴宜灿主持召开核安全所2020年中工作进展会，强调“核安全所作为合肥物质研究院的一员，将继续坚定支持研究院新形势下各项改革，要求全体科研人员继续保持疫情期间的科学理性，不造谣、不信谣、不传谣，鼓励全所人员心无旁骛，继续在科研一线做好本职工作，做出出色成绩。”
两个月内密集成立的“安徽中科凤麟系”
据接近核所的合肥院人士介绍，吴宜灿近年来将很大精力投入科研产业化。在各类官方背景的活动中，除了中科院院士和核所所长，他常用的头衔还包括“中科凤麟创始人”。
发布在核所官网上的资料显示，中科凤麟始于1986年，主要从事先进核系统研发及相关安全技术研究，源于中国科学院核能安全技术研究所，已发展成为以中科瑞华、中科超精、中科超安、中科石金等公司为技术产业化平台，与国内外多家科研机构密切合作建立的多学科交叉研究团队，重点研究领域涵盖中子物理、先进裂变核能、聚变核能、核技术交叉应用等。
中科凤麟官网正在淡化与吴宜灿之间的联系。当澎湃新闻（www.thepaper.cn）用高级搜索在该公司官网全网搜索“吴宜灿”时，搜索结果中有多条资讯已无法正常打开（Internal Server Error），比如该网站此前转载的一些媒体对吴宜灿的报道，以及《吴宜灿研究员当选中国科学院院士》、《吴宜灿研究员入选国家百千万人才工程》等等。
澎湃新闻以“中科凤麟”为关键词搜索“天眼查”时，出现9家存在密切关联的公司信息。其中，有成立时间较早的安徽中科超安科技有限公司（2015年10月成立，安徽哈德斯新能源科技有限公司持股66.67%、王芳持股22.22%、中科院合肥院持股11.11%，拥有中科凤麟商标），以及2020年1月成立的中科凤麟科技有限公司（由海美特（北京）工程技术有限公司100%持股）。
值得注意的是，另外7家以“安徽中科凤麟”打头的公司，均成立于2020年5月26日至7月3日之间。
5月下旬至7月初，7家以“安徽中科凤麟”打头的公司密集成立
有传闻称，从核所离职的员工大概率将入职上述中科凤麟系企业，或是主要从事中子照相无损检测产品开发的中科超睿（青岛）技术有限公司。截至发稿，澎湃新闻暂未确认有近期在离职风波中离开中科院合肥院的员工入职上述企业。
另外，上述公司的股东与高管名单中均未出现吴宜灿的名字。安徽中科超安科技有限公司、近两个月内密集成立的“安徽中科凤麟”，法定代表人均为胡菊萍，此人同时担任上述公司的高管。
胡菊萍疑为合肥院员工。2018年7月该院的一则消息显示，7月16日至7月24日，合肥研究院科技发展处组织所属科研单元、转移转化平台中12名从事成果转移转化工作的人员，参加了为期9天的“中科院与合芜蚌第十期成果转移转化人才培训班”。12名参训人员中包括胡菊萍。
胡菊萍在中科凤麟系的任职情况（点击图片看大图）
7月23日下午，澎湃新闻来到与“中科凤麟”相关的一系列公司的工商信息注册地址。其中，在同样以胡菊萍担任法定代表人的安徽中科核能安全技术研究所有限公司（6月18日由安徽中科超安先进技术研究院有限公司更名而来）地处的办公楼中，一位自称该公司所在楼层保安的人士未否认胡菊萍在此办公，但当澎湃新闻记者提出与之见面对话时，该人员称需要提前与胡本人预约。
