艾伦·伯尔，1756年-1836年
这次选举结果是联邦同盟党大败，亚当斯获得65票“选举人票”，杰斐逊和艾伦·伯尔都获得了73票“选举人票”。（现在美国共有538张选举人票）
问题就出在这里，当时并没有规定投给总统、副总统的票要分开，只是规定最高票获得者为总统、第二名为副总统。
为了保证杰斐逊当选总统，民主共和党要求党员“选举人”将所有的票投给杰斐逊，并少投艾伦·伯尔一票，这样杰斐逊就可以多一票而成为总统，艾伦·伯尔成为副总统。
但不知何故，操作中出现了失误。民主共和党的“选举人”都投下了两张选票，导致两人都获得了73张“选举人票”。
按美国宪法规定，这种情况下要由众议院投票决定谁当总统，谁当副总统。每个众议员都可以投票，然后按他们所代表的州进行汇总，赢者通吃，最后每个州计一票。当时美国一共有16个州，谁能赢得9个州的支持，就当选总统。
联邦同盟党在此次选举中已经失败，不过他们的舞台上的表演才刚刚开始。
在杰斐逊和艾伦·伯尔两人中，汉密尔顿尤其讨厌艾伦·伯尔，他曾说：“任何人，甚至连托马斯·杰斐逊，都比艾伦·伯尔强！杰斐逊并不危险，但伯尔是个危险的家伙。杰斐逊对政府的观点是错的，但至少还是个诚实的人。而伯尔这家伙完全没诚信，选他就等于毁了美国！”
但多数联邦同盟党议员认为，杰斐逊是既有思想又有威望的领袖，民主共和党是他创立的，他不可能听联邦同盟党的话。艾伦·伯尔虽然也是民主共和党人，但是他毕竟曾经加入过联邦同盟党，而且社会影响力相形见绌，可能会比较好控制一些。
这就出现了一个有趣的现象，投票给两个民主共和党的人，结果联邦同盟党更为纠结。
经众议院的投票，8个州支持杰斐逊，6个州支持艾伦·伯尔。必须过半获得9个州支持才能当选。只能再投一轮了……其结果跟第一轮一样，8个州支持杰斐逊，6个州支持艾伦·伯尔，分不出胜负。
众议院就这样一遍一遍反复地投票，一共投了27轮，还是一样。第二天早上，众议院决定先休息4个小时，然后中午继续投票，结果还跟昨天一样！
就这样一共僵持了3天，总共投了33轮票，结果都没有任何变化——8个州支持杰斐逊，6个州支持艾伦·伯尔。
总是选不出总统来，其关键就在佛蒙特和马里兰两个州。佛蒙特州支持杰斐逊和艾伦·伯尔的议员各占一半，只得弃权。
马里兰州有5名联邦同盟党议员和3名民主共和党议员，其中3名民主共和党议员当然是投票给杰斐逊，有4名联邦同盟党议员投给了他们比较喜欢的艾伦·伯尔，还有1名联邦同盟党议员却投给了杰斐逊，又平票了，只得弃权。
这两个州老弃权，就导致杰斐逊的支持票总是过不了半。
这时汉密尔顿出马了，在两个都不喜欢的人中，他只得选出一个比较不那么讨厌的人——杰斐逊就是那个比较不讨厌的人。
经过汉密尔顿对党内同志的极力游说，在第36轮投票中，特拉华州、佛蒙特州、马里兰州、南卡罗来纳州四州的联邦同盟党议员改投弃权票。
这一弃权所产生的变化可就大了，打破了之前的格局——这使得特拉华州和南卡罗来纳州从支持艾伦·伯尔改为弃权，而佛蒙特州和马里兰州从弃权改为支持杰斐逊。
其结果就是杰斐逊获得10州支持，艾伦·伯尔仅4个州支持，杰斐逊当选为美国总统，成为继华盛顿和亚当斯之后的美国第三位总统。
杰斐逊是第一个在新首都华盛顿办公的美国总统，之前的美国首都是费城。此时华盛顿只是一个很原始的小镇，各种政府大楼的土建才刚刚完成，甚至室内装修还没做完。但杰斐逊已等不急要搬过去了，杰斐逊深知，他面对的美国是一个各方面都亟待完善的国家。
