同时，太平公主充分利用皇帝对自己的信任，积极插手朝中事务，经营朝中势力。太平公主想做的事，李旦没有不答应的，自宰相以下官员任命，都是她一句话就决定了，由她推荐而平步青云担任要职的人数不胜其数。因此，在朝中形成了一股巨大的势力，甚至朝中的宰相有一半以上都是太平公主的人。
更为严重的是，太平公主不再安心做一个权势熏天的公主，而是积极在运作谋求拿下李隆基的太子之位，推举一位软弱容易控制的人当太子，将来继承皇位，更加方便自己专权干政，甚至觊觎帝位。如此一来，太平公主与太子李隆基的矛盾日益尖锐和公开化，已经到达了不可调和的地步。
李旦本来就性格软弱，没有决断大事的魄力和手段。因此，深受李隆基与太平公主之间矛盾的困扰。刚刚继位时，利用自己皇帝的身份，努力地稳定朝廷局面，竭尽全力地平衡中太子与公主之间的势力。三年之后，到景云三年（公元712年）时，李旦越来越感觉，这种平衡已经无法维持下去。太平公主是他唯一在世的妹妹，而且为他登基上位做出了突出的贡献，他实在是不忍心对她痛下杀手。而太子李隆基，由于在唐隆政变中的突出贡献，以及本身的足智多谋，其执政的班底已经形成，实力强大，李旦已经没有能力撼动其太子之位了。站在为李唐皇室责任的角度，李旦也深信大唐帝国的未来，一定属于自己的儿子李隆基，李隆基也一定有能力将祖宗留下的江山社稷推向新的辉煌。因此，到后期，保障李隆基太子之位的安全，也成了李旦的政治底线。
更让李旦忧心重重的是，他担心太子与太平公主的矛盾无法调和时，最终有一方会以军事政变的形式来解决问题，到那时自己的安全也难以保障。大唐从“神龙政变”以来的短短十余年间，已经连续发生了三次军事政变了，李旦绝不愿看到亲人之间的流血杀戮在自己的眼前再次发生。
在这样艰难复杂的心理状态下，唐睿宗李旦选择于景云三年（公元712年）七月二十五日，突然下诏，将皇位提前传给太子李隆基，自己退位为太上皇。但是，为了保证自己与妹妹太平公主的安全，朝廷三品以上官员的任命，以及一切重大刑狱有关的政务，仍由太上皇一手决断。也就是说，关键重要人物的升迁，以及关定人员生死的事情，仍然是自己说了算，虽然退位但最核心最关键的东西仍然紧紧抓在自己手中。
李旦希望通过自己的让位，让大唐帝国形成以儿子李隆基为中心的领导班子，以合法的形势保证了儿子的安全和帝国的未来。同时，也是希望以自己的退位，来告诫妹妹太平公主，在干政弄权的道路上要有所收手，退而求其次来保证自身的安全，也像自己一样，做一个清心寡欲的富贵公主，自己也会尽其所能，保障她的人生安全。
但是，李旦的美好愿望，最终却因为太平公主的不收手而没有实现。公元713年七月三日，李隆基再次以铁血的手段，带领禁军将太平公主的死党一网打尽，之后赐予太平公主三尺白绫。权倾一时的太平公主，被赐死谢幕！大唐帝国，正式进入了属于唐玄宗李隆基的时代，一个万众瞩目的盛世即将开启。
