原本这是朱元璋为了防止权臣整古作怪而设定的遗训，然而此后则成了朱棣起兵“靖难”的理由，毕竟这里头有一个条件：即“清君侧”需要建文帝先召唤藩王，藩王才能够起兵，且成功铲除所谓奸贼后必须五天内离开，因此朱棣可谓是司马昭之心路人皆知。
公元1402年，建文帝下落不明，而朱棣则凭借藩王之身晋级成功，明廷的大统血脉也由太子朱标转变成了燕王朱棣一脉。明成祖朱棣在位时期也是极为不错的，创下了“永乐盛世”，但不免还是有些遗憾，毕竟朱标一脉更为和顺，休养生息无疑更为合理。
建文帝朱允炆乃是朱元璋的皇太孙，是太子朱标身陨以后的官方继承人，也正是如此，朱家骨肉相残、同室操戈，四年的靖难之役光是参战损失就高达几十万，正所谓“兴，百姓苦；亡，百姓苦”。
事实上，就连朱元璋也高度夸赞朱棣最像他，文韬武略皆通，那么，为何朱元璋就是不看好朱棣而是将大位交付给乳臭未干的朱允炆呢？
在这儿就要提及太子朱标，也就是朱允炆的父亲，这位从小就受到朱元璋悉心栽培的太子可谓是指日可待，地位更是稳如老狗。朱标在世之时，支持者众多，这里头便多少朱元璋起家的“淮西勋贵”，蓝玉更是“知己”。
事实上，这些也是朱元璋所刻意培养的，目的就是为了此后继续北上剿灭北元残余势力，然而朱标的英年早逝终究辜负了朱元璋的重望。
朱标在时，压根儿没有朱棣什么事，即使朱标不在了，朱棣也不在考虑范围，这里头依旧是朱标的缘故。朱标虽亡，但还有儿子，这余下的下属们自然不会放弃这一机会而重新转投他人，因此朱允炆背后不仅有皇爷爷朱元璋撑腰也有着一大帮勋贵。
不过由于淮西勋贵过于强悍了，朱元璋为了皇太孙考虑，此后又剪除了诸多蓝玉等功臣，但朱允炆依旧有着巨大优势。如徐达之子徐辉祖，虽说是朱棣的大舅哥，但依旧是朱允炆的坚定支持者，是南军难得的将才。
武将如此，文臣同样如此，如方孝孺等便是。事实上，作为正统，朱允炆一方向来就优势多多，仅兵力而言，南军百万之师就远胜于燕军的三十万，更别提燕军资源不过是北京一带。因此，朱棣的支持率并不高，又怎么可能会被看好呢。
自古以来就讲究名正言顺，朱棣非嫡长子的身份就显得十分尴尬，更何况第四子的身份怎么也轮不到他（虽说二子、三子早于朱元璋逝世，但1392年朱允炆被立为皇太孙的时候还在世）
虽说古时有着“立嫡立贤”的争议，但显然嫡长子制度更为牢固，明廷的言官系统在这一方面便是一大力量。万历年间，国本之争便僵持了十五年，福王朱常洵即使受到万历宠爱也最终无缘大位，而这也是万历三十年不上朝的一大缘故。
这些朝廷大臣以册立长子为太子的原则而拥戴皇长子朱常洛，虽说朱元璋比之万历朱翊钧要果敢坚毅，但打破历来的规矩却也牵扯了诸多力量，得不到臣民拥护的太子还不如皇太孙呢。
另一方面，朱元璋并非不知道自己晚年时期的大动干戈，但为了皇太孙的稳固也只能如此，而朱棣显然是同一类人，因此朱允炆的确立无疑也是一种安抚。然而，朱允炆的犹豫也导致了败北，朱元璋剪除了蓝玉等人却也忘了“家贼难防”，而这只有后世人才能看得清。