廷尉，职掌刑辟，主刑罚断狱，是最高司法官。
典客，掌管少数民族入朝事务，主持接待、朝觐礼仪，典宾礼是它的主要职责。
宗正，掌管皇族事务。
治粟内史，主管国家的财政，如钱谷赋税收入及支出。
少府，主皇室的财政，管理山海池泽之税，供给皇室生活所需。其事务繁杂，机构庞大。
此外，中央的高级官吏还有：掌管京师治安的中尉、掌管修建宫室的将作少府、掌管少数民族事务的典属国等等。所有这些高级官吏，各自还有一些数量不等的属官、吏员，执行各种具体政务，组成中央庞大的统治机构。他们从丞相到诸大臣，“皆受成事，倚办于上”，一切政事均由皇帝裁夺。
秦朝的地方行政机构，推行的是郡县制。
郡县制不是秦朝首创。春秋战国时期，许多诸侯国已有郡县之设。但是秦朝建立后，郡县制作为地方行政制度，才开始在全国普遍推行，其行政机构也更加完善了。当时全国分为36郡，后来因边地陆续开发，郡的辖区不断调整，全国郡数增至40余郡。
秦朝的郡大县小，郡统辖县，是地方最高的行政机构。郡设郡守和郡尉，中央另设监御史。
郡守是郡的最高行政长官，主管一郡的政事，诸如郡内的民情风俗、农桑垦殖、司法治安、属县吏治、兵事军务等等。由于郡守负有治理地方之责，职重权大，秦对郡守的选任相当重视。如秦统一前夕，曾以职位相当列卿的内史腾出任南郡守，便是一例。守腾出任之时，秦在“南郡备警”，则郡守的职司不仅主民事，还负有军事方面的重责。
郡尉协助郡守，掌管军事，职位比郡守稍低。除了掌军务之外，有时郡尉也统兵作战。秦朝开发岭南地区，即由郡尉屠雎将兵击越人。
监御史职掌监郡，隶属于御史中丞，是中央监察地方的官员。其职责及地位特殊，既监察地方行政，也执行某些重大使命。
此外，京师为都城重地，所在郡县不设郡守，另设内史掌治京师，地位相当列卿。
郡下分若干县。县的行政长官称县令，不满万户的县称县长，掌管一县的政务。县设县尉，主管县内的治安、征发戍卒等。又设县丞，协助县令、长，并掌管司法。
在少数民族聚集的地区设“道”，道与县并行，性质同县的行政机构类似。
县下设乡。乡有三老，掌教化；有啬夫，主管司法、赋税；有游缴，管理治安。乡之下为里，里设里正，又称里典。里中有什伍的组织。
此外，秦时还有“亭”的设置，主要是维持地方治安，传递文书等。“亭”设亭长、求盗等亭吏。秦朝末年，刘邦以泗水亭长，为县送刑徒于驱山，基本与上述职能相符。其隶属关系，则更像县的派出机构，而不属于乡管辖。
秦朝的地方行政机构，分为郡、县两级制，它直属于秦朝中央统辖。郡县长吏由中央直接派遣，是中央在地方行使权力的代表。他们必须执行中央旨令，接受中央的监督和考核，从而使地方权力集中于中央。
随着上述政治制度的推行，秦朝关于官吏的选任、考课、赐爵、秩俸等，也有一整套相应的制度。
在官吏选任方面，秦朝沿袭商鞅变法以来的制度，废除世卿世禄制，实行“以功授官”的官僚制。在这种制度下，以军功授官是选任官吏的主要途径，一些在统一战争中立有军功，或者有特殊贡献的人员，秦始皇相继授予各种不同的官职。
对高级武官的任用，有的尊宠倍加，甚至成为几代人相袭的官职。秦将蒙恬及其父祖，还有王翦和他的子孙，都是三代相袭为高级将领。司马迁称“王氏、蒙氏功为多，名施于后世”。 显赫的军功不仅是仕进的阶梯，又是子孙袭封为武官的条件。从 “蒙恬因家世得为秦将”来看，秦朝武官世职的现象，显然属于恩荫之类的封赐。
然而，随着国家的统一，频繁的战争减少了，以军功选官的办法，已不能适应新形势的要求。尤其秦朝加强中央集权的各项措施相继推行，全国政事日益增多，国家各级机构需要各种人才， 因此其他的选官途径也同时并行。如征聘士人从政，或从低级吏员中征举人才，就是其中一种。前者如秦始皇时期，叔孙通以文学征，待诏于博士中；后者如萧何以郡卒史考课第一，监御史拟入奏朝廷征用萧何。这类征召性质的选官，被征之士去从可以抉择，如萧何即不应召。
